Die klassischen Strukturen im Wissenschaftssystem sehen sich vermehrt mit neuen Organisationsformen und inhaltlichen Vorgaben konfrontiert. Steigender finanzieller und Wettbewerbsdruck, der Bologna-Prozess, neue Kooperationsstrukturen wie Cluster und Netzwerke, die Exzellenzinitiative, interdisziplinäre Anforderungen – alles Beispiele, die für Wissenschaftsmanager neue Herausforderungen, aber auch Chancen bereithalten. Dieser Beitrag widmet sich insbesondere der Frage, welche Rolle dem Wissenschaftsmanagement für die inter- und transdisziplinäre Forschung im Kontext entsprechender Wissenschaftsstrukturen zukommt.